动画的故事舞台设定在现代的涩谷之中。主角织田龙平在小学时目击过憧憬的哥哥的神秘死亡现场。现在是高中生的他，早已摆脱了当时的恶梦。和平常一样练着拳击的某天晚上，他被奇怪的生物咬了一口，坠入了一个和平常不同的梦。
一半是人，一半是猩猩的新英雄！ 猩猩人和恐怖分子展開激烈衝突！！ 恐怖組織「動物解放同盟（ALA）」攻擊生物科學研究所時， 救了懷孕的黑猩猩，這隻黑猩猩產下了半人半猩猩的「猩猩人」查理。 15年後，查理在人類雙親的扶養下，進入高中就讀，認識了人類女孩露西。 另一方面，ALA的所作所為越來越激烈，甚至計畫要查理加入他們！
