Muv-Luv ATE全名为《Muv-Luv Alternative Total eclipse 》，全集动画片改编自《Muv-Luv Alternative》的外传小说。故事的时间设定在西元2001年，由于人类遭到地球外起源种(联合国称其为BETA)的侵略，正面临灭亡的危机，因此人类开始了先进战术机技术开发计划“XFJ计划”，各个国家均派遣了专门人员参与其中，该作讲述的就是这些被派遣过来的人员之间的故事。（有虫子吃掉妹纸情节,反差极大,请谨慎观看.）
为了迎接未知的挑战，闪电机甲全新升级加入作战，他们的机车可以变形为机甲状态，动物们可以通过跟小雨点结合进而召唤出带有动物特点的武器，对抗以霹雳为首的恐龙队。护卫队成员们在任务中相互协作，发挥各自特长，不仅帮动物们解决问题，还向动物们学习本领，一起成长！
羸弱的阿修罗少年有鱼目睹部落被屠后爆发惊人潜能，因而被先祖獠忌掳走。有鱼经獠忌地狱式的死炼折磨得以脱胎换骨，修炼成斗神五感和独特的斗魂之道。完成死炼后，有鱼与好友时雨重逢，但阿修罗弱肉强食的规则却将时雨迫害致死。意识到自身强大才是唯一的出路，有鱼踏上成王之路，决意成为至强者改写阿修罗规则！
